Para desarrollar su cometido en materia de seguridad aérea, AESA cuenta con el apoyo técnico prestado por tres empresas aeronáuticas incluidas en el ámbito del sector público y altamente especializadas: SENASA, INECO e ISDEFE.
SENASA (Servicios y Estudios para la Navegación Aérea y la Seguridad Aeronáutica), es una empresa integrada en el Ministerio de Fomento como Sociedad Instrumental, y encargada de dar apoyo técnico a la Administración en el ámbito aeronáutico.
INECO es una empresa creada en 1968 e integrada en el Ministerio de Fomento, que está especializada en la realización de todo tipo de estudios y proyectos vinculados, entre otros, con el sector del transporte aéreo.
ISDEFE (Ingeniería de Sistemas para la Defensa de España, S.A.) es una empresa creada en el año 1985 en el ámbito del Ministerio de Defensa con objeto de proporcionar apoyo técnico de ingeniería y servicios de consultoría en tecnologías avanzadas, tanto en el sector de defensa como en el ámbito civil.